[改善] 型注釈の追加とドキュメントの更新

- config.py, controller.py, model.py, mainloop.py, utils.py での型注釈の追加
- CODING_RULES.md と api.md のドキュメントを更新
- 不要なコードの削除とリファクタリング

src-python/models/overlay/__init__.py

@@ -0,0 +1,5 @@
+"""models.overlay package init for static analysis."""
+
+from . import overlay_utils  # re-export helper for ease-of-use in tooling
+
+__all__ = ["overlay_utils"]